由于杂交种的所有基因均来自2个亲本,杂交种的基因组中并没有产生出新的基因,但从表型上看,杂交种与亲本相比,在各种性状表现上却发生了明显的变化,特别是杂交种的一些重要经济性状甚至超过了最好的亲本,即表现出杂种优势.这说明亲本基因在杂交种遗传背景下表达方式发生了改变.因此,杂交种表现出杂种优势应该与其基因表达上的改变有关,这可能成为揭开“杂种优势机理之谜”的新的研究思路.我们利用DDRT-PCR技术对小麦不同杂种优势杂交种及其亲本之间基因表达差异进行了研究,发现①杂交种与亲本相比,基因表达模式发生了明显改变.这些差异表达模式包括:杂交种特异表达、单亲表达基因或双亲表达基因在杂交种中沉默、杂种表达增强、杂种表达减弱、偏高亲表达和偏低亲表达等.②不同发育时期叶片中差异表达基因比例不同.③杂交种不同组织器官差异表达基因比例也有明显不同.④发现一些转录因子基因家族(MADS-Box,GBF),Ser/Thr蛋白激酶基因以及蛋白质翻译起始因子Eif-4A基因在杂交种和亲本之间存在明显表达差异,差异表达比例远高于随机扩增的Cdna片段,如MADS-Box基因差异表达比例达到75﹪～95﹪.⑤初步揭示出强优势杂交种与弱优势杂交种之间基因差异表达模式不同,强优势品种间和种间杂交种中杂种特异表达基因和杂种增强表达基因多于弱优势杂交种.⑥克隆并测序了4个在杂交种和亲本之间差异表达Cdna,其中AG5为杂交种特异表达基因,编码一种新的RNA结合蛋白.⑦对20个双列杂交种及其亲本之间4种多基因家族基因差异表达分析发现,基因差异表达模式与杂种F1表现不相关,但与一些性状的杂种优势存在显著相关,其中,杂交种特异表达基因比例与某些农艺性状的杂种优势呈显著正相关,而亲本基因在杂交种中沉默比例与某些农艺性状的杂种优势呈显著负相关.