塞拉利昂埃博拉病毒的全基因组测序和进化分析

来源 :中国生物工程学会第六次全国会员代表大会暨第九届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gebmmi
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埃博拉病毒因1976年第一次发现于埃博拉河附近的村庄而得名.埃博拉病毒具有强烈的致病性,其生物安全等级为4级,在以往的疫情中病死率从25%到90%不等.2014年爆发于西非的埃博拉疫情是有史以来最大的一次疫情,其造成的感染人数和死亡人数超过了历次感染和死亡人数的总和.截至2015年9月18日已经造成2万8千余人感染,其中1万1千余人死亡,仅在在塞拉利昂就造成近4千人死亡.为积极配合国家援助西非埃博拉出血热疫情防控,我国政府派出移动实验室检测队与医疗队奔赴塞拉利昂,协助开展埃博拉病毒病的检测、留观与治疗.本文利用二代测序平台,对2014年9月至11月塞拉利昂疫情高峰期间的数百份阳性标本进行了高通量测序,获得 175份埃博拉病毒样本的全基因组序列,通过对这些全基因组测序进行分析,发现埃博拉病毒进入塞拉利昂之后遗传多样性急剧增加,出现多个病毒分支,而原有的部分病毒分支在传播过程中逐渐消亡;同时发现,虽然病毒遗传多样性快速增加,但变异速度并没有明显加快,而是保持着与以往的埃博拉病毒相似的变异速度,这一结论于2015年5月在线发表在Nature上,被随后相继发表于Science和Cell的几篇文章证实。这一结论打消了国际社会关于2014年埃博拉病毒加速变异的忧虑,增强了国际社会彻底铲除西非埃博拉疫情的决心和信心。由于测序数据取样时间跨度更长、样本量更大,因此结论更为可靠。本次大量的测序数据详尽展示了塞拉利昂埃博拉病毒的变异情况,为抗病毒药物和疫苗设计以及病毒现场检测提供了依据,也为进一步研究埃博拉病毒的生物学和病原学特征提供了基础数据。
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