基于转录组测序的甘草EST-SSRs标记研究

来源 :2015中国植物学会第十三届全国药用植物及植物药学术研讨会暨2015年海峡两岸中医药科学交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hbl7623308
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  甘草(Glycyrrhiza uralensis Fisch)是生长在我国西北干旱地区的多年生药用植物,其根和根茎是我国常用的大宗药材,也是食品、日用化妆品的添加剂,资源消耗量极大。目前,我国栽培的甘草尚无高产优质的品种,其药材有效成分的含量往往达不到《中国药典》的要求。基于表达序列标签开发的微卫星标记(EST-SSRs)可揭示植物基因组编码区域的遗传多态性,反映特定发育时期特定器官决定其重要表型的基因信息,是开发分子标记的重要技术,在辅助植物育种中具有极大的优势。本文使用Illumina HiSeq 2000对甘草根进行转录组测序,使用MIcroSAtellite identification tool (MISA)分析转录组中的SSR序列。在112158条转录组序列中,有14027条序列存在SSR标记,经鉴定的SSR标记共17584个。
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