小儿腹泻是常见痛和多发病，其中感染性腹泻仍是主要的原因。肠道菌群作为宿主内部的"微生物器官"在维护胃肠道甚至全身的健康起着极其重要的作用。本文通过深入探讨宿主-肠道菌群-病原微生物的相互关系，阐明维持肠道菌群的稳定和平衡通过以下得以实现：(1)肠道细菌逃脱或改变免疫反应；(2)宿主产生一些因子和酶类来修饰可能会引起典型炎症的肠道菌群成分，协助肠道菌群的耐受；(3)物理屏障耐受肠道菌群；(4)肠腔上皮TLR-4和(或)共活化分子的缺失能将病原体识别受体隔离。揭示了感染性腹泻是通过病原菌"掌控"肠黏膜炎症反应，由炎症部位提供病原菌代谢所需的营养素、排斥定植的肠道菌群、破坏上皮的物理屏障等导致肠道菌群改变。益生菌通过刺激和调节宿主肠道的免疫功能和生成细菌素抑制致病菌，清除超氧化物自由基，刺激肠道上皮黏膜生成黏蛋白等非免疫作用抑制病原菌。对今后开发全新的微生态制剂用于预防和治疗有着极其重要的价值。