hsa-miR-17-92cluster及其同源体的生物信息学分析

来源 :第九届长三角科技论坛暨营养科技论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangzu03
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的:对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程,为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法:①应用Pubmed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的所有研究,综述已有研究进展;②应用miRBase获取hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的各成员序列,并分析其序列特征及保守性;③应用NCBI blast、NCBI mapviewer、UCSC Browser工具分析hsa-miR-17-92cluster及其同源体的所在基因组序列特征;④应用TargetScan,PicTar及miRanda预测hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的靶基因,取三者预测结果的交集,进一步进行功能注释(Gene Ontology)和Pathway富集分析(Pathway Enrichment)。结果:①现有研究提示hsa-miR-17-92cluster及其同源体在脂肪细胞分化、肿瘤、心脏及肺发育、免疫系统和血管形成等生物学过程具有重要作用;②hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进化上高度保守,根据种子序列同源性可分为四类,且在多物种间非常保守;③hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的预测靶基因的功能,与细胞周期、细胞粘附、Wnt、TGF-β信号、P53、MAPK等信号通路具有较大的相关性,可能参与了前列腺癌、胰腺癌、结肠癌等多种疾病通路。结论:通过对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体系统的生物信息学分析,我们初步阐明了miR-17-92 cluster及其同源体的基本生物学特征,并为miR-17-92 cluster后续研究提供了功能与机制的线索。
其他文献
由贵州省农科院(邮编:550005)、贵州大学、贵阳市农科所共同承担的贵州省“九五”攻关项目“贵州主要蔬菜良种选育”,近日顺利通过贵州省科技厅组织的专家验收。 承担攻关任
  叶酸是人体不可缺少的营养元素之一,孕期补充叶酸制剂可以有效防治子代神经管畸形等出生缺陷。但在较发达地区存在过度服用叶酸的情况,存在一定的潜在风险。欧美国家实施强
什么性格最赚钱?我们来看一看如今打败股神巴菲特的人的性格,就能够明白。巴菲特是举世公认的股神,全球首富,但64岁的塞拉·佐豪森从46岁开始操盘,52岁接掌了一个濒临清算命
  目的:探讨LYRM1基因过表达对骨骼肌细胞ROS生成的影响.方法:培养大鼠骨骼肌细胞株(L6),分别以pcDNA3.1及LYRM1-pcDNA3.1转染L6,筛选、验证细胞株LYRM1的表达.诱导L6分化成
会议
F·肖邦逝世(1849)一百年后,中华人民共和国成立(1949),时间在流逝,但,一代一代的中国钢琴家为赢得“肖邦国际钢琴比赛奖”从没有停止过努力!今天有人争论:肖邦的音乐是否过
  目的:研究过氧化物酶体增殖物激活受体γC161→T多态性在学龄儿童中的分布及其与学龄儿童肥胖和血脂、血糖等血生化指标的关系.方法:按照整群分层抽样方法,从上海松江区6所
会议
  目的:评价LYRM1基因过表达对成熟骨骼肌细胞线粒体合成基因表达的影响.方法:体外培养大鼠骨骼肌细胞株(L6),分别将pcDNA3.1及LYRM1-pcDNA3.1转染L6,通过G418筛选稳定表达株
会议
  目的:对hsa-miR-335进行系统的生物信息学分析,预测hsa-miR-335可能参与的生物学过程,为本研究小组深入研究其在脂肪细胞分化中的功能和机制奠定基础.方法:通过miRbase获取
会议
  目的:研究锌离子螯合剂TPEN对脂多糖(LPS)诱导的小胶质细胞中细胞因子表达的影响及机制.方法:体外培养BV-2小胶质细胞后分为正常对照组、LPS组(100ng/ml LPS,30min或4h)、T
会议
  本文介绍了兔肉与其它肉类的营养成分比较,指出兔肉的营养特点,国际国内的兔肉发展状况及我国入世后肉兔面临的问题。