农村基层组织变革必须适应当前城乡一体化发展和新农村建设的现实需要，进行一系列的根本变革。农村基层组织改革与创新的基本思想是建立城乡有效衔接，党的领导与村民自治良性运行，农村自治组织社会基础不断扩大，农村自治组织、经济合作组织和社会公益性组织等各种组织关系顺畅的现代农村社区管理新机制。具体而言，要推动基层行政管理体制改革，乡镇一级实行乡派镇治.镇以下建居民委员会，乡级以下设立村公所作为乡派出处理政务的机构，全面统筹城乡社会发展。实行真正意义上的村民自治，是推动新农村建设、实现农村可持续发展的内在动力。加强党组织建设，建立城乡共建的党组织设置体系，发挥党组织的战斗堡垒作用和党员的先锋模范作用。理顺党政关系，实行“党政”分开，充分发挥党组织的组织领导、思想领导作用。实行“村社分开”，建立党组织、村民自治组织、村级合作经济组织以及其他公益性社会组织等各司其职、良性互动的组织体系。