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微卫星具有分布广、易检测、多态性高、共显性遗传和符合孟德尔遗传规律等优点,已被广泛应用于濒危动物的保护研究中.与二碱基、三碱基微卫星相比,四碱基微卫星由于不易产生滑带而分型更精确和可靠.本研究中,我们利用微卫星搜索软件MSDBv2.4 在本实验室测序的林麝基因组中获得了重复次数为4~58 次的8858 条四碱基微卫星序列,挑选其中的76 条序列设计微卫星引物,经过PCR 条件优化、多色荧光标记、基因分型扫描等步骤,最终筛选得到17 个多态性的四碱基微卫星位点.