PRRSV重庆分离毒株全基因组遗传变异分析

来源 :中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第四次猪病学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangxiaoxi21
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本实验采用RT-PCR和3-Full RACE技术,分段扩增、克隆了2006、2007年分离到的PRRSV毒株CBB-1和CWZ-1的全基因组,测序后拼接获得了2个重庆分离毒株的全基因组序列。CBB-1、CWZ-1株全基因组长度分别为15353bp和15344bp,序列比较显示二者的基因结构相同。CBB-1,CWZ-1与欧洲型毒株LV株同源性低于62.0%,与美洲型传统参考毒株全序列同源性在89.3%-97.1%,与变异毒株的同源性高达98.9%-99.4%。序列比较显示二者与参考变异毒株都在Nsp2的481位和532~560位不连续缺失30个氨基酸。参考国内外已发表的序列绘制进化树发现这2个分离毒株均属美洲型,从遗传进化以及变异情况看,与JxA1属同一亚群,这进一步证明了这种变异毒株成为我市的流行毒株。
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