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采用PCR-SSCP、PCR-RFLP技术对海南五指山猪及其近交系、海南黑猪的2个品系(临高猪、屯昌猪)的外显子4、外显子5、外显子6、内含子3进行了了多态性研究,分析该基因与五指山猪生长性状的相关性。结果表明,猪POU1F1基因外显子5、外显子6不存在多态性,内含子3、外显子4存在2个等位基因和3种基因型。在外显子4基因座上,五指山猪、临高猪、屯昌猪呈Hardy-Weinberg平衡状态,五指山猪近交系呈不平衡状态：群体遗传多态性检测均处于中度多态(0.250.5)。3种基因型与五指山猪部分生长性状的最小二乘法分析表明,PDU1F1基因不同基因型的体重问均无显著差异,但CC基因型个体比CD基因型个体在猪2月龄、8月龄、12月龄3个生长阶段都稍重一些。初步推断猪POU1F1门基因内含子3可作为五指山猪标记辅助选择的遗传标记之一。