山药是江西省瑞昌市重要的经济作物之一。近年来,山药病毒病在瑞昌山药种植区发生严重,其症状表现为叶片出现花叶、斑驳,明脉,影响山药正常的光合作用,对瑞昌山药的品质和产量造成很大影响。为了探明瑞昌山药病毒病病原,以便给当地山药病毒病发生规律研究和有效防治提供理论依据,采用分子生物学技术对其病原种类进行了鉴定。从瑞昌市高丰、范镇、桂林及白杨4个乡镇的山药种植区中采集获得18个感病叶片样本,提取样本中的总RNA,利用RT-PCR技术,通过马铃薯Y病毒科通用引物,对病毒序列进行PCR扩增,对扩增产物进行割胶回收、序列测定和序列分析。结果表明,这18个分离物与日本山药花叶病毒均具有最高的序列同源性(86%~87%),并且在构建的系统发育树上与日本山药花叶病毒共处于一个分支上;根据马铃薯Y病毒属CP同源性80%的种类划分标准,认为瑞昌山药病毒病病原为日本山药花叶病毒(Japanese yam mosaic virus)。18个分离物CP氨基酸序列之间同源性为92.9%~99.5%,同源性大小与病害发生地及其与症状类型之间不存在明显的相关性。