近年来,盐碱地和次生盐渍化土地面积日益增加,河南省为我国小麦的主产区,豫东平原为黄淮海平原的一部分,在黄河故道、黄泛区地带分布着较大面积的沙荒盐碱地,小麦种植面积与平均单产均受到了严重的影响。本研究利用种子萌发袋对89个近十年河南省小麦主栽品种进行了耐盐性鉴定,分别调查了最长根长和根数两个性状,并利用iSelect 90K SNP芯片进行全基因组扫描,并结合关联分析(Genome-wide association)的方法挖掘与小麦耐盐性相关的显著标记位点,结果表明:豫农201、豫农9901、花培3号和泛麦3号的最长根长和根数表现均优于其他85个品种,具有较好的耐盐性。利用TASSEL5.0软件中的一般线性模型进行标记与性状的关联分析,得到了8个在至少两次试验中重复检测到的位点,其中与最长根长显著关联的位点分别位于1BL、4BL和7AL染色体上;与根数显著关联的位点分别位于1BL、4AL、4BL、7BL和7DL染色体上。后续将进一步对关联到的显著性位点进行标记开发与验证,同时基于分子标记选择将显著关联位点基因组区段导入不同背景下的主栽品种中,为耐盐小麦品种遗传改良奠定基础。