基因表达谱芯片筛选喉鳞状细胞癌致癌基因的相关研究

来源 :2013国际暨全国第十二届头颈肿瘤学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:laowu000001
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目的:应用Illumina基因表达谱芯片技术对喉鳞状上皮细胞癌的致癌基因进行差异分析,筛选相关基因及通路并进一步验证。 方法:选择10对喉鳞状细胞癌组织和癌旁正常组织,每对组织取自同一患者。采用Illumina基因表达谱芯片技术,癌组织与癌旁组织进行差异分析。经Illumina Genomestudio-Gene Expression软件进行数据处理后,采用Average法和SAM法进行数据分析,取得差异基因。将差异基因在Web-based gene set analysis toolkit中进行在线GO分析、KEGG分析,得到有差异表达的功能基因和通路并进一步进行PCR验证。 结果:癌组织与癌旁组织进行差异分析,共得到361个差异基因,其中129个表达下调,232个表达上调;通路表达主要是DNA修复、细胞周期调控通路、p53信号通路与其相关;调控基因MCM2,MCM3,MCM4及CDK1、CDK2、CDK4与通路相关,经PCR验证在癌组织与癌旁组织中表达差异有统计学意义(P<0.05)。 结论:基因表达谱芯片能提供大量喉鳞状细胞癌相关基因的信息。分析这些差异表达的基因能够阐明喉鳞状细胞癌复杂的生物学特性及与基因表达之间的内在联系,并进一步识别和验证肿瘤发生的分子标记物.为进一步进行喉鳞状细胞癌分子生物学研究打下坚实的基础。
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