基于转录组的香梨优斑螟微卫星分析

来源 :第十一届全国青年植保科技创新学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Tiffany100
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为了开发香梨优斑螟种群SSR引物,用于其种群遗传结构研究,现对来自其转录组测序数据中微卫星序列进行分析。结果发现12264条序列含有SSR位点14011个,占总序列数的8.49%,平均距离为5.55kb,其中1433条的SSR大于1个;单核苷酸SSR为10988个,二核苷酸的1219个,三核苷酸的1585个,四核苷酸的202个,四核苷酸和五核苷酸的SSR都小于10个,其中复合型SSR为522个,占总SSR的3.73%。
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