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为了解造纸废水灌溉对滨海芦苇湿地的影响，测定了几种灌溉条件下湿地基质中的微生物数量、MBC/TOC和土壤有效硫等指标。结果表明：造纸废水灌溉能显著提高基质中微生物数量和活性，且受季节影响较明显，一般在9月份最多；微生物数量在基质内垂直分布规律是上层>下层，特别是放线菌、真菌；反硝化细菌与土壤TN，纤维素分解菌与废水COD去除率，及MBC/TOC与基质呼吸强度相关性较好；硫酸盐还原细菌数量在10月份以后激增，使基质变黑，但对芦苇根系影响较小。
废水灌溉能改良滨海盐碱土壤，促进退化生态系统的修复，但不同灌溉模式对微生物生理群的影响不同，推荐采用w4、w1模式。