基于16SrRNA基因的肠杆菌科动物致病菌的系统发育分析

来源 :中国动物学会原生动物学分会第十八次学术讨论会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:codemachine
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研究背景:肠杆菌科细菌种类繁多,广泛寄生于人、陆生及水产动物、植物及昆虫类.肠杆菌科内属、种的数量一直在不断增加,且随细菌鉴定技术的逐步提高,原有的分类系统也在不断的修正,肠杆菌科细菌的分类处于动态变化之中.为对肠杆菌科细菌现有的分类地位进行验证,并结合现有研究进行分类整理,且因植物致病菌和动物致病菌的16SrRNA基因不宜同时进行分析,本研究选用核糖体基因16SrRNA基因对肠杆菌科动物致病细菌进行了系统发育分析.方法从GeneBank获得肠杆菌科动物致病细菌16SrRNA基因,采用MrBayes v3.2进行系统发育学分析,用FigTree v1.4.2对结果进行视图化.结果 共对30个属194个种或亚种的194条序列建树,22个属相关序列各自合成一枝,Citrobacter、Cronobacter、Enterobacter、Escherichia、Pantoea等8个属的序列与其他属相互嵌入或独立成枝.讨论核糖体16SrRNA基因在进化过程中高度保守,又具有相对的特异性,是细菌鉴定和系统发育研究的重要标示基因,能很好的建立种间关系,但因肠杆菌科具有复杂、多源的特点,且很多属之间关系密切,具有许多共同性状,所以单一的16SrRNA基因并不能准确建立肠杆菌科各属之间的关系.结论 16SrRNA基因在肠杆菌科细菌系统发育研究中具有重要意义,肠杆菌科多属细菌具有的复杂、多源的特点,单一的16SrRNA基因并不能准确建立它们之间的关系.
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