利用 cDNA-AFLP技术鉴定马铃薯晚疫病菌小种特异无毒基因候选表达序列

来源 :2004年全国蔬菜分子育种研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhuhande
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通过对由具有6个无毒基因不同表现型的马铃薯晚疫病菌构建的4个混合池进行cDNA-AFLP分析、共获得85个与无毒基因相关的差异表达片段,其中与无毒基因Avr1、Avr2、Avr3-Avr10-Avr11、Avr4相关的差异表达片段分别为20,28,16和21个.将这些差异表达片段对20个晚疫病病菌个体进行无毒基因差异表达验证,得到无毒基因连锁群Avr3-Avr10-Avr11的修选片段1个,即A11T13Avr3-10-11S157;无毒基因Avr4的候选片段2个,即A24T19Avr4S125和A24T24Avr4S144.Blast分析表明:A11T13Avr3-10-11S157与马铃薯晚疫病菌正萌发孢子囊(germinating sporangium)EST(expressed sequence tag)库中的序列PG001F10.XT7同源;A24T19Avr4125与晚疫病菌正萌发泡囊(germinating cyst)EST库中的PH051G10.X17部分序列完全一致;未发现与A24T24Avr4S144同源的序列,说明此序列可能为一新的马铃薯晚疫病菌EST.A24T194Avr4S125与EST PH051 G10.XT7的序列一致性表明选择正工萌发的孢囊时期鉴定无毒基因的可行性,也为进一步快速获得全长无毒基因Avr4及进行功能验证奠定了基础.
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根据从Pentadiplandra brazzeana Baillon中分离获得的Brazzein甜蛋白基因的氨基酸序列,人工合成了全长168bp(含有转录起始位点ATG以及终止子TAA)Brazzein甜蛋白基因,并克隆至pMD18-Teasy vector上.测序结果表明所获得的基因与Brazzein甜蛋白基因序列完全相符;同时从番茄中克隆果实特异表达启动子pE8,构建番茄果实特异表达载体pB
对不结球白菜细胞质雄性不育系及其保持系DNA进行RAPD分析,在其不育系中获得了两条稳定扩增的片段OPAX1和OPAF12,序列测定结果证明OPAX1DNA序列全长为773bp,其碱基组成为A+T=54.20﹪,A+G=42.69﹪.序列中含有多个起始和终止密码子,推断可以编码含9~74个氨基酸残基的9个多肽片段.通过序列查询发现它与已报道序列的同源性均很低,表明该片段为新发现的不结球白菜DNA序
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对108份我国茄子主要地方品种和35份主要选育品种进行了基于形态性状和基于PAPD/ISSR标记的遗传多样性分析,结果表明地方品种的遗传多样性(遗传多样性指数总和18.06)高于选育品种(15.83).聚类分析表明,地方品种和选育品种都可以分为4个类群,并在多变量对应分析中得到验证.此外,我们的研究还表明,在茄子种质资源遗传多样性研究中,ISSR标记是一种多态性丰富、简便高效的标记手段.