甘西鼠尾草Salvia przewalskii味微苦、性微寒,具有调经、活血等功效,主治月经不调、风湿痹痛、子宫出血等症,因与丹参功效类似,已在我国11个省区作为丹参的代用品使用,《中华本草》也将甘西鼠尾草作为中药丹参的来源.目前,甘西鼠尾草的来源以野生采挖为主,造成药材品质不稳定,生态环境破坏严重等一系列问题.此外,甘西鼠尾草分布区环境差异大,在长期适应进化过程中,使其体内的化学成分均产生了较大差异.本文利用HPLC指纹图谱技术结合主成分分析和聚类分析方法,从化学成分指纹图谱和有效成分两个方面探讨甘西鼠尾草不同居群之间的化学变异,为甘西鼠尾草的有效开发和用药安全提供理论依据.通过对提取方法和色谱条件的优化,利用HPLC法建立了14个居群的化学指纹图谱,共提取出27个共有峰.27个峰保留时间的相对标准偏差从0到0.48％,表明所有样品具有较高的一致性.27个峰峰面积的相对标准偏差值从31.37％到153.70％,表明在不同的居群间,其化学成分的含量表现出极其显著的差异性.主成分分析和聚类分析的分析结果表明,14个居群被分为三组.对比海拔高度发现,三个类别海拔高度的区别较为明显,因此,海拔高度为其变异的一个影响因子.