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本文报道鲤雌雄亲本间的遗传距离与子代经济性状存在一个曲线的相关关系，获得最优子代的雌雄亲本关系存在一个“阈值”，基于此“阈值”理论建立了基于雌雄亲本遗传距离的鱼类分子育种技术，并设计了计算机选择育种软件；本文也在11个鲤鱼家系中对多种经济性状进行数量性状定位，依据高紧密连锁的QTL结果，分析了这些QTL基因座杂合基因型与纯合基因型对性状形成的意义，结果显示：决定鲤鱼经济性状的所有QTL存在一个平衡：即具有正效应杂合基因座的数量与纯合基因座数量间是平衡的(杂合优势基因座～60％，纯合优势基因座～40％)，基于这个平衡理论，设计了基于经济性状 QTL结果的分子育种技术，也设计了此育种技术的计算机选种软件，同时，通过几个镜鲤家系中的大个体与小个体的基因型检测，证实个体生长速度与基因型的相关性符合上述平衡理论。