东太平洋结核区沉积物中细菌多样性及锰细菌的分离鉴定

来源 :第七届全国微生物资源学术暨国际微生物系统与分类学研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jackfbi
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  构建了东太平洋结核区WBC1305和WBC1306 2个站位沉积物16s rDNA文库,进而分析了2个站位细菌多样性;采用传统分离培养方法,利用锰细菌筛选培养基,开展了两个站位沉积物中耐锰细菌分离和分子鉴定,在此基础上筛选出锰氧化细菌.文库结果分析表明,WBC1305和WBC1306站位中的细菌隶属于25个纲(Cytophagia、Thermoanaerobaculum_c、Thermobaculum_c、Acidimicrobiia、Acidobacteria_c、Alphaproteobacteria、Anaerolineae、Bacilli、Betaproteobacteria、Clostridia、Dehalococcoidetes、Deltaproteobacteria、Gammaproteobacteria、Nitrospira_、Phycisphaera、Planctomycetacia、Ardenticatenia、Caldilineae、Caldithrix c、Elusimicrobia_c、Flavobacteria、Gemmatimonadetes_c、Ignavibacteriae、Solibacteres、Sphingobacteria),其中前3个纲是WBC1305站位特有的纲,而后9个纲为WBC1305特有的纲.分析还发现,虽然2个站位优势纲相同,其所占比例由高到低排列均为Alphaproteobacteria、Bacilli、Gammaproteobacteria,但2个站位的优势属存在差异,WBC1305站位优势属所占比例由高到底排列为Shewanella、Bacillus、Lactococcus,而WBC1306站位优势属所占比例由高到底排列为Lactococcus、Bacillus、Bosea.通过菌落形态差异,分别从WBC1305和WBC1306站位挑取并纯化获得194和146株耐锰细菌.16s rDNA分子鉴定结果表明,340株耐锰细菌分布于5个纲(Gammaproteobacteria、Alphaproteobacteria、Bacilli、Actinobacteria_c、Bacteroidia)17个属(Pseudomonas、Pseudoalteromonas、Marinobacter、Moritella、Halomonas、Alcanivorax、Psychrobacter、Rheinheimera、Shewanella、Bacillus amyloliquefaciens、Planomicrobium、Staphylococcus equorum、Brevundimonas、Erythrobacter、Microbacterium、Bacteroidia和Mariniphaga),其中Gammaproteobacteria均是2个站点的优势纲,该纲中的Pseudomonas、Psychrobacter、Shewanella3个属也均是2个站位中的优势属.采用联苯胺盐酸盐溶液滴定法对340株耐锰细菌进行锰氧化活性测定,共鉴定出锰氧化细菌164株,它们分布于2个纲(Gammaproteobacteria、Bacilli)9个属(Psychrobacter、Marinobacter、Pseudoalteromonas、Moritella、Pseudomonas、Shewanella、Halomonas、Rheinheimera、Bacillus amyloliquefaciens),其中Shewanella属中的锰氧化细菌在2个站位中所占的比例均为最高,其次为属Psychrobacter.
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