基于单分子测序的中药蛹虫草基因组、甲基化组、转录组完成图及其药效单体代谢途径的调控机制研究

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【摘要】

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<正>应用单分子测序技术,获得蛹虫草子实体基因组300X数据。组装后获得14条contigs,最长为4.58 Mb,最小为0.35 Mb,N50为2.86 Mb。其中有4条是头尾带有末端端粒序列的完整染色

【作者】

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陈玉皎赵星宇吴玉乾秦笙韩薇邵明辉王博

【机构】

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天津大学人类基因组研究中心; 正源堂(天津)生物科技有限公司; 天津市盘古基因科学发展有限公司; 西南大学生物技术学院; 江苏科技大学生命科学学院;

【发表日期】

：

2016年期

【关键词】

：

单分子测序蛹虫草基因组转录组甲基化模式 N6-(2-羟乙基)腺苷麦角甾醇代谢通路调控机制

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<正>应用单分子测序技术,获得蛹虫草子实体基因组300X数据。组装后获得14条contigs,最长为4.58 Mb,最小为0.35 Mb,N50为2.86 Mb。其中有4条是头尾带有末端端粒序列的完整染色体序列。另外8条在一端有这种特殊序列。确定和分析了14条contigs的所有甲基化位点及其Motifs,发现m6A甲基化模式主要为GA和GGAG形式。m4C主要为GC

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