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软件生产企业的行业特殊性决定了它在税法适用上的特殊性.在各种宏观政策中，核心政策是对软件生产企业的税收优惠.国家作出一系列税收优惠，对软件产业的促进是显而易见的.但还有诸多亟待完善的地方：国家对发展软件产业的税收政策不到位，促进度不够：双主体税制使现行软件生产企业的税收优惠政策有失偏颇；增值税制度加重了软件生产企业的税收负担；软件产品的税负界定及税款抵扣问题没有得到很好解决.所得税，以区域优惠为主、行业优惠显得不足，优惠方法直接化、单一化；同时也缺乏必要的个人所得税优惠；软件生产企业的税收征管工作存在众多问题；相关税收法律、法规的具体条文不够明确等。通过对我国软件生产企业现行税收法律适用缺陷的分析，给出笔者认为应进一步完善的建议.