三化螟线粒体基因组及种群遗传多样性研究

来源 :第四届中国西部动物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tianjinajun
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  三化螟是重要的农业害虫.本研究测定了三化螟线粒体全基因组(15,220 bp),它包括了13个蛋白质基因(PCGs),2个rRNA,22个tRNA和一个A-T富集区(控制区).该全序表现为AT偏移,A+T含量为77.2%.除了COI基因的起始密码子为CGA外,其余的蛋白质编码基因都是以ATN为起始密码子.三化螟线粒体A+T富集区具有鳞翅类昆虫A+T富集区共同的一些特点,但在三化螟中没有发现位于tRNAMet上游的poly-A结构.利用COI基因对不同地理种群三化螟的遗传多样性和遗传结构进行了分析,36个三化螟COI基因共有9个单倍型,9个单倍型中共发现17个多态性位点(polymorphic sites),占总碱基的3.12%,其中包括10个单变异位点(singleton variable sites)和7个简约信息位点(parsimony informative sites).通过DNAsp软件分析得知,三化螟的单倍型多态性(Hd, haplotypes diversity)指数为0.763,核苷酸多样性(π,nucleotide diversity)指数为0.00916.采用NJ法构建的COI基因系统进化树的结果显示,印尼三化螟聚成一个进化枝,中国德阳、西昌和海南三化螟并没按地理来源聚类,显示中国三化螟没有明显的地理种群结构.
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