基于晶体结构的环氧水解酶催化过程解析及其工程化改造

来源 :2012年全国博士生学术论坛——发酵工程 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nihaonan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  环氧水解酶(EC 3.3.2.3)能催化水分子立体选择性地加成到环氧底物上,生成相应的邻位二醇.此类水解酶普遍具有较好的位置选择性和对映选择性,因此成为动力学拆分消旋环氧化物制备手性环氧与二醇的理想催化剂.在前期研究中,我们克隆表达了来自Bacillus megaterium的环氧水解酶BmEH(Bacillus megaterium EpoxideHydrolase),对苯基缩水甘油醚(PGE)及其衍生物具有很高的活性及对映体选择性.然而对于具有较大取代取团的PGE衍生物,如经典降压药物普萘洛尔合成前体萘基缩水甘油醚的活性和选择性却处于较低水平.本研究利用X-ray晶体衍射的方法解析得到了BmEH分辨率为1.75 (A)的三维结构以及BmEH与底物类似物苯氧乙酰胺结合状态下的复合物结构(1.95 (A)).结构分析表明BmEH属α/β折叠类环氧水解酶,包含催化结构域和帽子结构域,位于两者之间活性中心由催化三联体Asp97、His267、Asp239和辅助底物结合与环氧开环的Tyr144、Tyr203等关键残基组成.与已知环氧水解酶结构相比,BmEH在活性口袋外侧具有疏水性底物预结合位点,活性口袋中保守的Trp98可与底物苯环形成π-π相互作用.分析亲核进攻残基Asp97与活性口袋相对位置表明BmEH具有与已知环氧水解酶结构相反的底物进入方向.结合复合物晶体结构及分子动力学模拟结果,我们确定了BmEH位于活性口袋底部的结构区域具有高度灵活性,由此推测BmEH活性口袋具有动态产物释放通道.总结BmEH催化机理为:环氧底物首先结合于酶蛋白表面的疏水区域,然后进入活性口袋完成环氧开环水解反应,最后产生的二醇通过动态产物释放通道被排出.据此催化机理在活性口袋周围选择了可能限制产物释放及底物结合空间的关键残基进行定点突变,其中M145A突变体对底物NGE相比于BmEH wildtype比活提高26倍.利用M145A粗酶液在两相反应(20% v/v异丙醚)条件下对20 g/L萘基缩水甘油醚进行拆分,反应最终ees达99.3%,分离得率44%,产物二醇ee值89%,得率43%.
其他文献
会议
会议
会议
会议
会议
会议
含糖废水来源于以淀粉、糖蜜等为原料发酵、提取产品的过程,该类废水年排放总量约20-25亿吨,占全国工业废水总排放量的10%左右.含糖废水的共同特点是色度高、含盐量高、有机物浓度高,含有大量可发酵的糖质,造成COD很高,一般在几万.例如淀粉废水年排放量2400万吨,废水COD达40000mg·L-1,味精年排放高浓度废水2500万吨,COD达30000-50000mg·L-1.如果进入污水处理系统,
脂肪酶和酯酶是工业应用中最重要的酶。随着基因技术的发展,无论是从基因数据库中进行数据挖掘,还是宏基因组方法,使得人们能越来越容易地发掘各种潜在有用的脂肪酶和酯酶。然而在我们已得到的那些酶中,同样拥有巨大的新应用潜力。我们认为,已有酶库中筛选候选酶的方法,有两种策略。一种是针对某一反应或某一底物,设计高效的筛选方法,是酶与底物"多对一"的方法。而第二种,为酶建立一个关于它对结构多样性典型底物活性的指
促溶离子对反胶束萃取蛋白质收率有着显著影响,本文在利用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)萃取脂肪酶.通过改变促溶离子(尿素和盐酸胍)浓度以调节反胶束萃取脂肪酶的收率,利用动态光散射仪检测有机相中反胶束尺寸的变化,同时使用卡尔-费式水分测定仪测定有机相含水量,探讨促溶离子浓度、反胶束含水量、反胶束尺寸及反胶束萃取收率之间的关系,为揭示微观水平的促溶离子,表面活性剂,水分子,蛋白质分子之间的相互作用机制
By genome data mining, a carbonyl reductase tool-box was designed and developed for chiral alcohol synthesis.Based on systematic comparison of the specific activity and substrate tolerance towards α-c