基于Cytb基因探讨中缅树鼩的遗传多样性

来源 :第十二届野生动物生态及资源保护学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:libing09006
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  中缅树鼩是我国特有的小型哺乳动物,是潜在的新型模式动物.本研究基于11个地理种群的Cytb基因1073bp研究中缅树鼩的遗传多样性.123个样本中A+T(55.8%)的比例高于C+G(44.2%),其中发现变异位点数为262个,66种单倍型.基于NJ法的最大组成似然模型构建的进化树,共分为4支,分别是大新种群、海南种群、片马和腾冲种群,其余种群聚.AMOVA分析表明种群间的方差占总变异的75.12%,种群内的方差占总变异的24.88%,表明变异主要发生在种群间,各种群间基因流均小于1,可能发生了一定的种群分化.中缅树鼩中性检测的Tajimas和Fu and Lis D检验结果均不显著,表明中缅树鼩拒接种群扩张模型.
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生物有氧代谢过程中会产生活性氧类(Reactive oxygen species,ROS),ROS产生速率超过机体抗氧化保护能力时,会对大分子物质如脂质、蛋白、DNA产生氧化损伤,对机体造成氧化应激。"自由基假说"认为代谢率提高,氧化应激也会增强,反之亦然。
繁殖期是哺乳动物能量需求最高的生活史阶段,在此期间母体显著增加能量代谢以满足哺育后代的能量需求。活性氧类(ROS)是能量代谢的副产物,当机体产生的ROS超过抗氧化修复系统的保护能力时,出现氧化应激,对机体造成氧化损伤。"生活史假说"认为在能量和资源有限的条件下,母体在自身维持的能量支出和后代的能量需求之间进行权衡。
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中缅树鼩(Tupaia belangeri)隶属攀鼩目(Scadentia)树鼩科(Tupaiidae)树鼩属(Tupaia),作为东洋界特有的小型哺乳动物,其主要分布在我国云南、广西、贵州、四川及海南地区.本文通过对分布在我国10个地方的中缅树鼩进行采样.通过对其肌肉组织的DNA提取,经PCR扩增测序获得1398bp COⅠ基因序列.112条COⅠ基因序列共定义了64个单倍型,单倍型多样性(Hd
为了探讨中国不同地区中缅树鼩的代谢差异和机制,本研究采用气相色谱-质谱联用仪(Gas Chromatograph-Mass Spectrometer-computer,GC-MS)对12个不同地理种群134个中缅树鼩样本的血清和肝脏进行代谢组学测定,检测代谢通路中的代谢物。结果 显示:血清中一共注释到96种代谢物:包括氨基酸24种、有机酸20种、脂肪酸12种,核苷酸5种、磷酸4种、多元醇7种、糖类