水稻白叶枯病菌广西菌株K74的全基因组测序

来源 :中国植物病理学会第十一届青年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wwwvvv79
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  水稻白叶枯病是世界范围内最重要的水稻细菌性病害.该病在我国各稻区也频繁发生,对粮食生产的危害极大.水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)对水稻的侵染依赖三型分泌系统以及通过该系统分泌到水稻细胞中的三型效应物.水稻白叶枯病菌基因组中大量存在的由avrBs3/pthA基因编码的TAL效应物,它们对水稻白叶枯病菌的致病力起至关重要的作用.该家族效应物通过特异识别、调控寄主某些基因的表达达到干扰寄主免疫系统,为自身定殖、扩展提供条件.从广西防城港疫区分离到的高毒性水稻白叶枯病菌K74在IRBB系列水稻鉴别品种上的反应明显有别于国内外已知菌株,前期RFLP分析表明该菌株的avrBs3/pthA基因带型也明显区别于已知菌株,因此,对该菌株的深入研究将对本地区的粮食生产有积极的推动作用.作为对该菌株致病机理以及抗病途径的深入研究的基础,本实验室已经将该菌株通过高通量测序技术进行全基因测序.目前已经得到36个contig,gap的补全工作正在进行.由于avrBs3/pthA家族基因的特点,一般的高通量测序以及常规测序无法准确地得到这些基因的准确序列.因此,我们也针对K74菌株中该家族基因进行有针对性的克隆和测序,并已得到多个avrBs3/pthA基因的精确序列.通过本研究,我们得到了K74菌株的基因组草图以及多个avrBs3/pthA基因的精确序列,为下一步更深入地研究广西水稻黄单胞菌致病机理及防治手段提供了良好的基础和支持.
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