圆斑星鲽肌肉和脾脏组织cDNA文库构建及部分ESTs分析

来源 :第十届全国水产青年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:weidingsen
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  分别以健康圆斑星鲽(Verasper variegates)肌肉、脾脏组织为材料,构建了圆斑星鲽肌肉和脾脏组织的经典cDNA文库.对文库质量的分析结果表明:两个文库的库容量分别为5.0×106和1.1×106,重组率分别达到97.3%和93.2%,平均插入片断长度大于800 bp.随机从文库中选取cDNA克隆进行5端测序,总共进行了1 058(肌肉:578,脾脏:480)个成功反应,得到1 002(肌肉:541,脾脏:461)个ESTs,初步拼接得到621(肌肉:192,脾脏:429)个单基因簇(Unigene),其中包括110(肌肉:87,脾脏:23)个重叠群(Contigs),511(肌肉:105,脾脏:406)个单拷贝EST(Singletons).通过BLASTX和BLASTN搜索、比对、查询和注释,结果显示318个基因簇有相关同源性,其他的303(48.8%)条序列没有明显的同源性(E-valu≤ 1.00×E-5),本研究为进一步开展相关基因的克隆和分子标记的筛选奠定了基础.
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