果梅Tyl-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

来源 :第十一次全国李杏会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qlp9463
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本文是以果梅甲州小梅(Prunus mume‘Jiazhou Xiaomei)的春梢叶片为试材,以Tyl-COpia类逆转座子逆转录酶保守片段对应的兼并引物进行PCR扩增、克隆。研究了果梅中Tyl-COpia类逆转座子逆转录酶序列的特点。研究发现,由于存在着缺失和终止密码子突变,果梅基因组内Tyl-COpia类逆转座子存在着很大异质性,例如:PM19在3′端发生了明显的缺失,并有11条序列发生了1-4个终止密码子:并且由于物种间的差异,果梅基因组中的逆转座子与其他物种问存在着较大的差异。在对克隆到的果梅逆转录酶序列,进行了聚类分析,可以将着37条序列分成3个家族;其中第一个家族包含了16条序列,并与芥菜(Brassica juncea)有着很高的相似性;第二家族和第三家族分别包含8条和13条序列。将克隆到的37条序列(DQ494215-DQ494251)与已在Genbank上登陆的不同物种的同类型逆转座子的逆转录酶进行了聚类分析,发现果梅中Tyl-COpia类逆转座子与芥菜、苹果、缘毛杨、挪威云杉、玉米和水稻中同种类型的逆转座子可能有相同的起源。这对进一步研究果梅基因组内逆转座子的特性有重要的意义。
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