饲料中的营养素在机体内首先经过胃和肠道的首过代谢,再吸收入血进入靶器官进行代谢沉积。因此,营养素在肠道中的代谢成为机体营养物质代谢的关键。同时,肠道中栖息着数量庞大复杂多样的微生物菌群,肠道微生物在宿主健康中发挥着重要作用,既影响着食物消化、营养吸收和能量供应,又调控着宿主正常生理功能及疾病的发生发展。微生物对营养物质的代谢在不同肠段内并不相同。小肠主要进行大分子营养物质的消化吸收,尤其是小肽和氨基酸。然而,并不是所有的氨基酸都能完全进入血液,有30%~60%的必需氨基酸被门静脉排流组织截取。最新研究表明,小肠中部分氨基酸有可能是微生物代谢的。此外,不同区室生态位的微生物对氨基酸的代谢也表现出不同特征。大肠中的微生物菌群庞大,并进行着复杂多样的发酵和代谢。小肠内未被消化的蛋白质和非消化碳水化合物(如非淀粉多糖)进入大肠,被大肠内微生物发酵从而进一步利用。碳水化合物在盲肠和结肠内被微生物发酵产生大量短链脂肪酸,这些短链脂肪酸对宿主有着重要的生理功能,如调节肠道菌群,改善肠道功能,给宿主尤其是结肠上皮提供能量等。动物胃肠道不仅是消化器官,还是感应器官,肠道对营养物质的感应可以通过脑肠轴调节机体生理活动。肠腔内的肽和氨基酸可以被胃肠道上皮细胞表面的受体识别,包括T1R1、T1R2、T1R3、GPR93、CaSR、GPRC6A等。肠道微生物还能够代谢蛋白质产生宿主细胞不能合成的肽类物质,其通过小肠上皮的肽类转运系统影响机体代谢,因此可能存在脑肠微生物轴(微生物-肠道-大脑轴,bug-gut-brain axis)。肠道微生物还可以与机体形成宿主-微生物代谢轴(host-microbe metabolic axis),对动物机体营养物质代谢和免疫稳态起重要作用。日粮对宿主代谢的改变,常伴随有肠道微生物区系的变化,肠道微生物的代谢可能通过微生物-肠道-大脑轴以及宿主-微生物代谢轴又能调节宿主很多生理过程,进而影响机体整体代谢。本文概述了猪肠道微生物组成与营养物质的代谢的关系,以加深对肠道微生物对机体代谢贡献的认识。