引起仔猪传染性腹泻病的病原主要有猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(RV),这三种病原的传染途径和发病过程相类似,具有发病急、传播速度快,哺乳仔猪感染率和死亡率都较高的特点,临床诊断和控制难度较大。近年来辽宁省哺乳仔猪传染性病毒性腹泻病发生较为严重,给养猪业造成了巨大的经济损失。为查明辽宁省仔猪病毒性腹泻病主要病原的种类,明确主要流行病原的分布情况,从而制定有针对性的防控措施,开展了辽宁省仔猪病毒性腹泻的病原调查及PEDV的遗传变异分析。为了解辽宁猪流行性腹泻病毒(PEDV)来源及变异特性,经PCR诊断,细胞分离,细胞病变观察、RT-PCR以及S基因序列鉴定,成功分离1株PEDV毒株(LN-2015-1)。S基因序列分析显示,与CV777毒株相比,除点突变外,分离株还出现最长9bp的插入,6bp的缺失和13bp连续突变。氨基酸也存在最长3aa插入和2aa缺失,同时存在4处连续3个及以上的氨基酸突变,抗原表位分析表明在5个表位区共发生16个氨基酸的突变。同源性分析显示与HB-HA2015毒株的同源关系最近,序列相似性为99.2%,与2010年以来国内外代表变异毒株同源性较高,达到98.5-98.8%,而与2010年以前的传统同源性较低,在93.2%-95.6%之间;进化树分析显示该毒株与近年来国内外流行的变异毒株属于同一群,并且与HB-HA2015形成一小的分支,而与传统毒株进化距离较远。