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生物信息学工具SIFT和PolyPhen通过分析目的蛋白序列的保守性以及突变氨基酸的生化特性来预测氨基酸的替换对蛋白质功能造成的影响。从而可以对对错义突变产生的影响进行初步的预测,同时可用于验证关联分析所得到结果的可靠性。本研究随机选择的10个基因的12个错义突变中,SIFT和PolyPhen对其中10个突变的预测保持一致,同时与表型性状的关联分析结果保持一致。对另外两个突变预测纬论虽然相反,但关联分析数据与PolyPhen的结论保持一致。