广西地区2008-2011年猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2基因的遗传变异分析

来源 :广西畜牧兽医学会养猪学分会2011年年会暨学术报告会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chen19107
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  为了解广西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况,对2008-2011年间来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行Nsp2基因的扩增和测序分析。结果显示,所获得的49个毒株均为美洲型毒株,其中46株具有高致病性变异毒株的序列特征,即其Nsp2蛋白缺失第481位aa和第533-561位aa,其余3株不具有上述缺失,属于PRRSV传统毒株。广西地区49个毒株Nsp2基因问的核苷酸序列及其推导氨基酸序列的同源性为84.8%-99.7%和89.7%-99.6%;与VR-2332、CH—1a、HB-1及JXA1株的核苷酸序列及其推导氨基酸序列的同源性分别为80.5%-83.7%和74.5%-77.9%、89.7%-92.6%和84.4%-88.4%、92.4%-96.3%和89.0%-94.5%、92.8%-99.3%和88.7%-99.3%,而与LV株核苷酸序列及其推导氨基酸序列的同源性仅为51.0%-53.9%和29.6%-32.5%。基于Nsp2基因核苷酸序列所绘制的遗传进化树,可将所有美洲型PRRSV毒株分为4个亚群,广西地区的49个毒株有3株分布在以HB—1株为代表的Ⅲ亚群,46株分布在以JXA1株为代表的IV亚群。表明,当前广西PRRSV流行毒株均为美洲型毒株,并且以Ⅳ亚群为优势基因亚群,各毒株间的Nsp2基因序列存在一定的差异,但没有明显的地域特征。
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