鸡卵巢高产蛋性能相关基因的筛选

来源 :第七届中国畜牧科技论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangtianyu66
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鸡蛋是人类的一种优质蛋白食品来源,近年来中国鸡蛋总产量持续上升,并连续多年居世界第一.产蛋性能及蛋品质性状是鸡重要的生产性状,直接影响养鸡业的生产效率和经济效益.畜禽的繁殖性能主要受HPG轴的调控,且分段明显,包括产蛋期、就巢期和恢复期3个时期,由于卵泡生长、成熟、排卵和就巢期时垂体产生的激素不同,在相关基因的调控下,卵巢进行着生长和萎缩的交替变化,影响着家禽在整个产蛋周期中的产蛋量.本研究采用四川农业大学家禽育种场相同条件下笼养的856只芦花鸡为研究对象,准确记录从开产直至300日龄的产蛋量。300日龄产蛋量排名靠前的200只鸡和靠后的200只鸡分别设为高产组和低产组。300日龄时根据鸡的产蛋规律和产蛋量分别筛选高、低产组各三只体重相近、健康的鸡,采集卵巢组织,提取RNA,检测合格后构建cDNA文本库,采用Illumina HiSeq 2500测序平台进行RNA-Seq测序。采用Cutadapt软件去除测序接头,Prinseq软件进行数据质控,Blast软件进行污染评估,Tophat软件进行数据比对,RSeQC软件进行数据匹配比率统计,Cuffdif2软件进行差异基因检验,MeV软件进行比较分析,DAVID在线软件进行GO和KEGG功能富集分析。
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