【摘 要】
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革胡子鲶在很多国家是一种重要的淡水养殖鱼类,该鱼具有抗病性强的特点,但目前对该鱼抵抗病原微生物的分子机制研究较少。因此,本研究采用腹腔注射法用维氏气单胞菌人工感染
【机 构】
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天津市水产生态及养殖重点实验室天津农学院水产学院;
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革胡子鲶在很多国家是一种重要的淡水养殖鱼类,该鱼具有抗病性强的特点,但目前对该鱼抵抗病原微生物的分子机制研究较少。因此,本研究采用腹腔注射法用维氏气单胞菌人工感染革胡子鲶,运用RNA测序技术对其脾脏转录组进行分析。4个转录组文库(对照组1个,攻菌后3 h、24 h和48 h各1个)共拼接得到263,825个转录本和156,955个unigene,unigene平均长度为1082 bp,全部注释到七大数据库中。KEGG分类到免疫系统中的基因数为2029个,其中有1180个为差异表达基因。GO富集显示这些差异基因在生物学过程、细胞组分和分子功能三大类中富集显著的前两个GO分支分别是免疫系统过程和免疫反应、MHC蛋白复合物和MHCII类蛋白复合物、趋化因子活性和趋化因子受体结合。KEGG富集得出最为显著的前两个通路依次是趋化因子和Toll样受体信号通路,分别有248和162个差异基因。本研究结果为探讨革胡子鲶对病原菌的免疫应答反应积累基础数据。
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