微生物组是指特定微环境中的微生物群体或这些微生物的基因组，在自然界的生物过程几乎都是通过微生物组完成的。随着测序技术进步和成本降低，微生物组已经成为微生物生态学研究的热点和新兴领域。土传病害抑制性土壤是自然界生物防治的典范，早期的研究发现了特定土传病害抑制性土壤中关键的生防因子，但是应用这些生防因子并不能有效防治响应的植物病害，最近的研究表明，土传病害抑制性土壤常常有根际微生物功能菌群参与。继合成生物学之后，基于微生物组的合成功能菌群研究正在兴起，从而我们提出土传病害抑制性土壤是有关键生防因子和功能微生物群共同作用的结果。土传病害抑制性土壤微生物组的研究为我们认识和揭示与抑制性土壤相关的功能微生物群提供了有效途径，基于关键生物因子和功能微生物群研发合成功能菌群是土传病害有效防治的关键途径。