毛竹基因组序列的测定和分析

来源 :2011国际生物经济大会——第九分会场:生物资源与生物多样性 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cxtctb
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  毛竹(Phyllostachys heterocycla cv.pubescens)是世界上最大的温带竹种。在亚洲,毛竹具有极高的生态,经济和栽培价值。但毛竹的基因组研究非常滞后,在数据库中毛竹的基因组数据也非常稀少。这严重妨碍了禾本科植物的比较基因组学研究的完整进行。因此,本文着重分析了毛竹基因组序列,结果显示,毛竹基因组具有大比例的重复序列,这纠正了以前报道中,毛竹重复序列比例的低估。经过重复序列的预测和统计,我们发现约65%的毛竹基因组由重复序列组成,这大大高于二穗短柄草(28%)和水稻(40%),与高梁(62%)相当,低于玉米(84%)。其中长末端重复型(LTR)逆转座子这类重复序列具有最大的比例。
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