中国特有濒危植物南方红豆杉的谱系地理学研究

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南方红豆杉(Taxus wallichiana var.mairei)隶属于红豆杉科(Taxaceae)红豆杉属(Taxus),是我国特有的第三纪孑遗植物,属国家1级濒危保护物种。它为常绿乔木,雌雄异株,风媒传粉。其典型特征为叶背面有两条白色的气孔带。该物种分布区域广,涉及我国华南、华中、华东、西南和西北等地,是研究环境变化如何影响物种分布格局的理想材料。我们利用2个叶绿体DNA(cpDNA)片段(trn L-trn F和atp B-rbc L)对南方红豆杉22个种群进行了谱系地理学研究,以揭示其种群动态的演化历史。结果显示:1.共鉴定出39个单倍型,其中32个为私有单倍型;2.该物种具有高的单倍型多样性和核苷酸多样性(h=0.705±0.016,π=0.00154±0.00015);3.AMOVA分析表明南方红豆杉呈现出显著的遗传结构(FST=0.710,P <0.001);4.Mantel检验发现种群存在"isolation by distance"式样;5.基于单倍型构建的系统发育树与TCS结果相吻合;6.BARRIER分析显示,蓝屏(LP)和兀名(WM)种群与其它种群存在着地理隔离;7.中性检验和错配分析表明南方红豆杉经历过种群扩张事件;8.BEAST推测大约在82.85Ma南方红豆杉的种群开始分化;9.存在多个小型冰期避难所,如井冈山大井(DJ)、鹤峰(HF)、高台(GT)和天平山(TP)。
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