【摘 要】
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目的:初步探讨基因3型和4型HEV能跨物种传播,而基因1型和2型HEV不能跨物种的传播的影响因素. 方法:根据不同基因型HEV宿主选择的不同,将从GenBank上下载的87株已知全基因组
【机 构】
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天津医科大学总医院检验中心生化检验科
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目的:初步探讨基因3型和4型HEV能跨物种传播,而基因1型和2型HEV不能跨物种的传播的影响因素.
方法:根据不同基因型HEV宿主选择的不同,将从GenBank上下载的87株已知全基因组序列的HEV参考株,分为两类(H类和Z类,H类包含基因1型和2型病毒株,Z类包含基因3型和4型病毒株).并通过序列比对分析,寻找可疑的导致两类HEV病毒株间宿主选择差异或致病性差异的核苷酸或氨基酸突变位点.
结果:本研究在两组病毒株间共发现了25个可疑的决定不同基因型HEV宿主选择性差异的核苷酸或/和氨基酸突变位点;其中ORF1区16个,ORF2区有7个,ORF3区有1个,5和3UTR区各1个;特别是5UTR区的G11A/C、E2s蛋白决定簇区的T511S及ORF3区的E78D可能是最重要的宿主选择性差异决定子.
结论:25个特异性核苷酸或氨基酸突变位点的发现为研究和认识不同基因型HEV宿主选择性和致病性差异提供了重要线索和新的视角.
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