为了探究湖南环洞庭湖区农业生态系统的生态效率，揭示该区域人与自然资源和环境的相互关系，本文以能值理论为研究方法，以该区域农业2009年的经济投入—产出数据作依据，对该区域农业生态系统的能值结构、功能和效率作实证分析，结果表明该系统在结构功能和效率方面存在如下特点：(1)结构：投入结构方面，该系统农业械化程度相对较高，化肥对系统的贡献率最高，能值密度相对较大，对劳动力和畜力的依赖程度较低，说明该系统已摆脱了自然农业的低水平状态，现代化水平较高。产出结构方面，种植业、林业、畜牧业和渔业的产业分布不均匀，其中，林业和渔业有很大的发展空间。该系统产品定价偏低，忽视了自然资源和环境对农业生产的贡献，尤其是种植业产品表现得更为明显，不利于农民增收和农业的可持续发展。 (2)功能：从环境负载率和可持续发展指数等指标看，该系统属于富有活力和发展潜力的系统，自然资源和环境的压力不是很大，但是系统还是承受了过多的人口就业，人口承受力超载。(3)效率：该系统2009年的能值投入产出率高于全省平均水平，农业生产的规模效应和集聚效应逐渐体现。因此，继续实行粮食价格的保护价，进一步缩小工农产品的价格剪刀差，进一步调整农业产业结构和产品结构，加强农业技术开发和利用，延长产业链，转移剩余劳动力，提高农业机械化和现代化水平是当前该区域农业的基本政策取向。