我国资源严重短缺，同时常规农业资源浪费严重并造成了严重的环境污染，只有发展生态农业才是我国农业的根本出路。循环、再生和可持续发展是生态农业的主要特点。而沼气发酵是实现生态农业系统能量转换、物质循环及农业废弃物综合利用的最佳途径和中心环节，是联系生态系统中生产着、消费者和分解着的纽带。利用沼气发酵，可以将污染环境的废物转化为能量和优质肥料，并消除其对环境的污染，从而达到社会效益、经济效益和生态效益的统一，实现我国生态农业的可持续发展。 本文对沼气发酵进行了介绍，阐述了沼气发酵在生态农业中的应用，并分析了沼气发酵在生态农业中的应用效益，综上所述，沼气发酵生态农业系统建设，是实现农业的整合、协调、循环、再生的好路子。它使农业产业结构更加优化，是兼顾生态效益、社会效益和经济效益，实现生态环境保护，资源综合利用的成功模式。是解决我国农村人口、经济与资源环境发展之间矛盾的有效途径，也是我国农业可持续性发展的必然选择。