分析并评价隧道等下穿工程施工过程中对渠道下部地层以及整个渠道结构的影响是长距离输水工程关注的重点问题。针对相关问题,本文以郑州某工程盾构隧道下穿南水北调总干渠为例,利用有限元数值模拟对隧道下穿总干渠施工过程进行了分析并与施工过程中实际沉降观测数据进行对比,从宏观上分析了隧道施工对渠道带来的影响及渠道沉降变化规律。针对施工过程带来的渠道下部地层土体扰动变化情况,本文结合土体扰动变化后形成的物性参数变化对地层波速产生的影响,研究并通过无损方式获取了工程穿越前后横波波速变化图,在对比了各典型测点波速变化与渠道整体沉降变化的基础上,综合给出了下穿工程对渠道下部地层土体扰动带来的影响。通过上述分析,本文认为综合外观变形规律等观测与内部土体扰动等物性结构变化对比,可综合分析下穿工程对渠道结构的影响。通过上述研究,本文认为这种综合对比分析方法可为类似下穿工程对渠道结构的影响分析提供借鉴。