尽管中国的水资源短缺问题十分严峻，但从某种程度上说，更值得关注的是水污染问题，特别是像浙江这样的南方省份。比较熟悉的是地表水污染，比如太湖，由于附近流域的农业生产中大量施用的富含氮磷钾等营养元素的化肥流到湖里面，使得蓝藻发育过头了，就造成了水污染。地下水污染不容易看到，但中国地下水水质状况也十分令人担忧。另外，过度开采地下水会带来地面沉降，造成严重的经济损失。杭嘉湖地区就是一个很好的范例。“五水共治”归根到底是对地表水和地下水进行联合管理。地表水和地下水其实是一个资源，相互联系，频繁转换。节水可能是提高水效率最主要的出路。我国对资源、能源、水的利用跟西方发达国家相比，效率还比较低。“水-能源-粮食”相互联系，密不可分。生产能源需要大量水资源，反之，水资源的利用也需要消耗大量的能源。同时，农业是水的最大用户。水资源大约有百分之六七十都用在农业。所以，“五水共治”还要从“水-能源-粮食”相互联系的视觉加以考虑。