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电喷雾串联质谱技术与生物信息学软件相结合被广泛地应用于蛋白质组学的研究.利用串联质谱技术测定蛋白的基本步骤是:将串联质谱获得的肽的碎片与假定肽沿着肽骨架断裂形成的理论碎片相匹配,根据匹配符合度推测蛋白结构.由于实际肽的碎裂方式受氨基酸序列和组成等多种因素的影响,导致肽的碎片信息丢失或实际产生的碎片峰度与理论谱图有较大的差异,直接影响蛋白的准确测定[1].