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会议论文
探索有机小分子的稳定构象
探索有机小分子的稳定构象
来源 :第十三届全国量子化学会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chencr33
【摘 要】
:
本文应用ABEEMσπ/MM 方法,探索有机小分子稳定构象.该方法能够快速获得与从头算B3LYP/6-311++G(d.p)方法相同的稳定构象数目,并且二者得到的骨架二面角十分接近.
【作 者】
:
姜新蕊
杨忠志
【机 构】
:
辽宁师范大学 化学化工学院 辽宁 大连 116029
【出 处】
:
第十三届全国量子化学会议
【发表日期】
:
2017年期
【关键词】
:
有机小分子
稳定构象
方法
二面角
从头算
B3LYP
象数
骨架
分接
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本文应用ABEEMσπ/MM 方法,探索有机小分子稳定构象.该方法能够快速获得与从头算B3LYP/6-311++G(d.p)方法相同的稳定构象数目,并且二者得到的骨架二面角十分接近.
其他文献
氮-甲基乙酰胺无机盐水溶液体系的动力学模拟
离子溶剂化一直是科学家研究的热门课题[1-2]。离子体系中带有明显的极化作用且电荷转移不可忽略,传统的固定电荷力场不能准确描述离子体系的极化效应和电荷转移效应。
会议
甲基
乙酰胺
无机盐
水溶液体系
电荷转移
子体系
离子溶剂化
转移效应
从头算和ABEEMσπ/MM对(CH3OH)n(n=3~12)和[M(CH3OH)n]+(M=Na,K)团簇的研究
应用从头计算(ab initio)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场方法(ABEEMσπ/MM)对环状甲醇团簇(CH3OH)n(n=3~12)体系、[Na(CH3OH)n ]+(n=3~6)体系和[K(CH3OH)n ]+(n=5~8)
会议
从头算
体系
电负性均衡
相关性质
甲醇团簇
分子力场
电荷分布
从头计算
发展应用于DNA体系的ABEEMσπ极化力场
DNA 在人体生命活动中起着至关重要的作用,DNA 结构的稳定性主要靠氢键与堆叠作用维持。要准确模拟DNA 体系中的这两种作用首要是准确模拟体系的极化效应和电荷转移效应
会议
发展应用
DNA
模拟体系
极化效应
转移效应
生命活动
稳定性
人体
应用ABEEMσπ/MM对赖氨酸稳定结构研究
在运用ABEEMσπ/MM[1]探究赖氨酸二肽稳定构象中,调节了模型分子支链上二面角参数,将已调好的二面角参数直接转移到三肽上,来保证研究体系的参数一致性。
会议
赖氨酸
稳定构象
角参数
直接转移
一致性
体系
探究
三肽
应用ABEEMσπ/MM方法探讨甘氨酸和苏氨酸的稳定构象
本文本文在Gaussian09 量子化学软件和GaussView5.0 可视化软件中应用B3LYP/6-311++G(d,p)方法对甘氨酸及苏氨酸二肽、三肽分子结构优化,并以从头算B3LYP/6-311++G(d,p)
会议
方法
甘氨酸
苏氨酸
稳定构象
B3LYP
三肽
平均绝对偏差
分子结构优化
应用ABEEMσπ/MM探索天门冬氨酸二肽三肽的稳定构象
本文应用ABEEMσπ/MM[1]浮动电荷极化力场方法,对天门冬氨酸[2]二肽和三肽结构进行扫描优化,并对其构象进行总结分类,得到其相应的9 组二肽和50 组三肽的稳定构象。结果
会议
天门冬氨酸
二肽
三肽
稳定构象
方法
计算结果
电荷极化
一致性
应用ABEEMσπ/MM方法探究半胱氨酸多肽的稳定结构
本文应用浮动电荷极化力场ABEEMσπ/MM[1],以天然氨基酸中半胱氨酸二肽、三肽为模型分子调节其支链二面角参数V1、V2 与V3,调节后以从头算的计算结果为蓝本进行对比,得
会议
方法探究
半胱氨酸
多肽
天然氨基酸
稳定构象
三肽
计算结果
分子调节
发展适用于8-oxo-G与氨基酸残基相互作用体系的ABEEMσπ极化力场
为使遗传信息保持完整,修复酶会自动修复受损DNA[1,2],这一微观机制的关键是修复酶相应残基与氧化碱基间复杂的氢键相互作用[3,4]。基于ABEEMσπ极化力场(ABEEMσπ PFF
会议
氨基酸残基
相互作用体系
极化
修复酶
氢键相互作用
二面角
重新定义
氧化
卤素离子水溶液体系的从头计算和ABEEM浮动电荷分子力场研究
采用量子化学方法计算X-(H2O)n(X-=F-/Cl-/Br-/I-,n=1~6)团簇体系的结构、结合能和电荷分布。结果表明,团簇体系最稳定构型是H2O 中H 直接与卤素离子配位;当外层配位水分子
会议
卤素离子
水溶液体系
从头计算
电荷分布
相互作用
水分子数
量子化学方法
最稳定构型
应用ABEEMσπ浮动电荷力场和从头算方法研究CH3COAla-Pro-TyrNHCH3四肽水溶液中的结构和性质
通常人体中的化学反应是在水中进行的,氨基酸作为构成蛋白质的基本单位,研究其在水溶液中的各种性质就显得尤为重要。本文对CH3COAla-Pro-TyrNHCH3 四肽进行研究,先在B3L
会议
电荷
力场
从头算
方法研究
四肽
水溶液
结构
稳定构象
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