自2006年以来,中国油菜籽种植面积大幅度下降,而国内对油脂产品需求十分强劲,因此需要从国外大量进口油菜籽以缓解国内油脂产品供不应求的矛盾。加拿大是世界油菜籽第一出口大国,也是2002年以来中国油菜籽进口第一大市场,进口额比例不断上升。但是,来源于加拿大的油菜籽经常携带多种具有危害性和传染性的种传病原真菌,这些病原真菌一旦随进口种子传入国内油菜籽产区,必然会给我国油菜籽产区带来重大损失。为了对这类真菌进行全面的风险评估,开展进口加拿大油菜籽病原真菌多样性研究是十分必要的。本研究利用冷冻吸水纸法和琼脂平板法对3个进口批次、共9个仓的加拿大油菜籽进行病原真菌的培养、分离、纯化,记录其生长状况,对分离出来的每株真菌进行形态学鉴定,并结合常规PCR检测方法,对所提取的菌株DNA进行检测,最后通过测序及序列比对分析,确定每个菌株的属(种)。结果表明:进口加拿大油菜籽上病原真菌具有丰富多样性,在分离的200余株病原真菌中,共有16个属20余个种,主要以链隔孢属(Alternaria spp.)、生赤壳属(Bionectria sp.)、油菜黑胫病菌(Leptosphaeria biglobosa)和油菜茎基溃疡病菌(Leptosphaeria maculans)为主,检出率均为100%。在分离的200株菌株中,数量最多的是链隔孢属(Alternaria spp.),所占比例高达60%,其次是生赤壳属(Bionectria sp.)约占10%,油菜黑胫病菌(Leptosphaeria biglobosa)约占8%,油菜茎基溃疡病菌(Leptosphaeria maculans)约占6%等。