种群多样性和入侵历史对于检疫、控制和根除一种入侵害虫来说是非常重要的.目前种群研究主要是利用分子手段，基于线粒体基因来实现的，例如线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ基因(COI).然而，当种群间的COI基因变异程度非常低的情况下，进行数据分析和信息挖掘是非常困难的，而单一的基因数据得出的结果未必可靠.因此在本研究中，我们利用三种内共生菌和多序列位点联合分析法(MLST)来揭示柑桔黄龙病的媒介昆虫亚洲柑桔木虱Diaphorina citri的种群遗传多样性和入侵历史.对采自亚洲主要柑桔产区的77个柑桔木虱种群和佛罗里达、夏威夷各1个种群的mtCOI基因进行测序分析，鉴定出34种COI单倍型，并推断得到其种群结构.结果表明种群遗传多样性非常低，特别是在东亚和南亚地区，其中H2是这些地区频率最高的单倍型.对45个种群的95个个体的三种共生菌Carsonella ruddii、Profftella armature和Wolbachia进行多序列位点联合分析，结合柑桔木虱单倍型和共生菌表明曾在中国东南部和美国夏威夷发生过柑桔木虱的多重入侵.Carsonella ruddii的分布格局揭示了明显的地理结构和入侵路径.此外，鉴定发现柑桔木虱体内Wolbachia的多重感染，很可能是通过水平传播得到的.