【摘 要】
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根据杜仲转录组以及基因组测序,克隆及鉴定萜类物质合成途径中3个反式异戊二烯二磷酸合酶,分别命名EuTIDS1、EuTIDS3、EuTIDS5,本文对这3个基因启动子顺式作用元件潜在功能以及基因组序列和编码区的氨基酸序列的组成成分、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构、结构保守域以及基因组内含子和外显子结构特征等进行分析.结果发现,EuTIDS家族含有大量基本顺式作用元件TATA-box,
【机 构】
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中南林业科技大学,经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙 410004;中南林业科技大学,林学院 湖南长沙 410004
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根据杜仲转录组以及基因组测序,克隆及鉴定萜类物质合成途径中3个反式异戊二烯二磷酸合酶,分别命名EuTIDS1、EuTIDS3、EuTIDS5,本文对这3个基因启动子顺式作用元件潜在功能以及基因组序列和编码区的氨基酸序列的组成成分、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构、结构保守域以及基因组内含子和外显子结构特征等进行分析.结果发现,EuTIDS家族含有大量基本顺式作用元件TATA-box,CAAT-box以及光(AE(-)box、CGT(-)motif、Box 4)、茉莉酸(CGTCA(-)motif)、生长素(AuxRR(-)core)以及与干旱(MBS)相关等多个顺式调控元件,对这3个基因启动子顺式作用元件进行比较发现启动子作用既有保守型,又有多样性.EuTIDS1、EuTIDS3 均编码348个氨基酸残基,EuTIDS5均编码349个氨基酸残基;EuTIDS1、EuTIDS3和EuTIDS5基因转录起始位点自2001bp,预测显示基因组共含含外显子12个,内含子11个.
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