2006~2016年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因进化动态分析

来源 :2018年广西畜牧兽医学会养猪分会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhouyonge
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  为研究广西猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传进化情况,对2006年-2016年间,来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行了病毒Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因的扩增、测序及进化分析.结果表明,获得的Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因序列分别为158、215、144、222个,均为美洲型毒株;Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因核苷酸及其推导氨基酸序列的同源性分别为86.8%~100%和61.7%~100%、80.8%~100%和80.5%~100%、90.6%~100%和89.9%~100%、85.6%~100%和87.1%~100%;基于Nsp2、ORF5、ORF6及ORF7基因核苷酸序列分别绘制的进化树可将所有毒株分为6个亚群,而广西流行的PRRSV毒株主要分布在以JXA1株为代表的亚群6.Nsp2、ORF5、ORF6和ORF7的平均进化速率分别为1.69x10-1、1.58x10-2、9.7lx10-4、1.86x10-3substitutions/site/year.Nsp2基因最容易发生变异,其次是ORF5基因与ORF7基因,而ORF6基因最稳定.本研究为掌握PRRSV的分子流行病学及遗传进化规律提供了相关的基础数据.
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