斑石鲷眼点淀粉卵涡鞭虫rRNA基因的克隆与序列分析

来源 :中国水产科学研究院黄海水产研究所第十二届研究生学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:HUANGKAO2
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  眼点淀粉卵涡鞭虫渤海株是斑石鲷育苗期的主要寄生虫病原.为了确定该病原的系统分类地位,本研究设计了两对特异性引物,利用PCR方法扩增出了病原的两个DNA片段,克隆到pEASY-T5载体中.测序后拼接得到长度为4737 bp的眼点淀粉卵涡鞭虫渤海株rRNA基因序列.通过Blast比对发现,该序列由573 bp的部分小亚基rDNA、352 bp的内转录间隔区1、159 bp的5.8 S rDNA、692 bp的内转录间隔区2和2955 bp的部分大亚基rDNA串联而成.将上述序列与国内外已报道的眼点淀粉卵涡鞭虫rRNA基因进行比对分析,结果发现:渤海株与地中海分离株、红海分离株、美国分离株和宁德分离株相似性在98.2%-99.4%.构建的系统发育树显示,渤海株与地中海分离株、红海分离株、美国分离株和宁德分离株聚为一支,为同一种.上述研究证明眼点淀粉卵涡鞭虫在全球生态系统中呈现单一性分布,无种属特异性.
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