RNA-蛋白质相互作用预测及描述符设计

来源 :中国化学会第29届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dilanmeng
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  蛋白质-RNA相互作用在细胞代谢中起着至关重要的作用,包括pre-mRNA转录及转录后修饰、mRNA稳定性、mRNA细胞内定位及蛋白质翻译等过程[1].越来越多的基于蛋白质序列和结构的计算方法被成功地应用于蛋白质的RNA结合残基预测,且为阐明重要生物过程的发生机制提供了参考.本文采用设计的两种全新的描述符,即残基静电势和残基三联体交界面倾向性,并结合数种基于蛋白质序列和结构特征设计的常用描述符建立了随机森林预测模型,实现快速高效地预测蛋白质的RNA结合残基的目的.针对文中建立的预测模型进行五则交叉验证,AUC值高达0.900,体现出模型的良好应用价值.经测试表明,该模型优于其它同类方法,可有效地区分蛋白质的RNA结合残基和非结合残基.
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