本文伊始，首先要厘定“海峡两岸跨境犯罪”的概念。在海峡两岸犯罪方面，大陆地区与台湾地区适用的概念并不完全相同，如大陆地区通常使用的是“跨境犯罪”、“两岸犯罪”等概念，随着两岸政治关系的缓和，两岸经贸交流日益增多，但两岸跨境犯罪也随之而来，特别是近几年来两岸的跨境犯罪大幅增加，犯罪种类以及手段等也出现很多新的特征，这极大损害了两岸的经济、社会稳定。为了打击日益猖獗的两岸跨境犯罪，两岸签订了一系列协议，特别是2009年《两岸共同打击犯罪及司法互助协议》的签订更是开启了两岸合作打击犯罪的新局面。但该协议在具体实践中，不仅要受到两岸政治定位上的制约，也存在诸多问题，大大限制了该协议的实施效果。因此，在未来构建海峡两岸合作打击犯罪模式时，需要进一步协商和细化两岸合作打击犯罪机制的内容，并将其制度化、规范化和法制化。